计算生物学揭示ALS患者中的RNA变化

肌萎缩侧索硬化症（ALS）是一种破坏运动神经的疾病，目前约有30,000名美国人受到影响，但医生们仍不清楚其病因。为了为更好的检测方法奠定基础，托马斯杰斐逊大学的研究人员Phillipe Loher、Eric Londin博士和Isidore Rigoutsos博士采用计算生物学的方法来研究ALS如何影响血液中的分子。

在《分子神经生物学》杂志上发表的一项研究中，该团队分析了大约300名ALS患者和非ALS患者的血液样本。研究重点是小非编码RNA（sncRNAs），这些短分子有助于调节基因表达和其他重要的细胞过程。Rigoutsos博士及其团队之前在杰斐逊计算医学中心的研究已经表明，帕金森病会影响血液中的sncRNA水平。Rigoutsos博士想看看这种情况是否也适用于ALS。

研究发现，ALS患者的sncRNA组合与非ALS患者不同，某些sncRNAs甚至与诊断后的生存期相关。

有趣的是，分析还揭示了一些不属于人类基因组的sncRNAs。

“许多随疾病变化的分子来自细菌或真菌，”Rigoutsos博士说。虽然研究团队还不知道这些变化是ALS的原因还是结果，但结果表明微生物组在该疾病中起着重要作用。

Rigoutsos博士表示，计算生物学方法通过分析大量数据来发现隐藏的sncRNA模式，对于理解ALS等神经退行性疾病以及开发更准确的诊断和预后工具至关重要。

“我们可以在计算机上进行测试，这些测试在实验室里可能需要数月甚至数年的时间才能完成，”他说。“这种方法超越了人们仅通过查看电子表格所能做的事情。”

来源：

托马斯杰斐逊大学

(全文结束)